Articles

de evoluerende rol van natuurlijke producten uit de tropische regenwouden als een aan te vullen bron van nieuwe Drug Leads

reclame

moderne benaderingen in drug discovery uit natuurlijke producten

de komst van nieuwe technologieën in massaspectrometrie, NMR en andere spectroscopische technieken, bimoleculaire doel-of celgebaseerde screening, vroege hit-karakterisering en het gebruik van computationele methoden hebben de impact van natuurlijke producten in de HTS gebaseerde drug discovery verbeterd. Natuurproductextracten bevatten vaak een groot aantal bestanddelen die moeilijk te scheiden zijn. De ondubbelzinnige structuren van zuivere samenstellingen kunnen door de combinatie van conventionele technieken zoals ultraviolette absorptiespectroscopie (UV), IR, MS en NMR worden bepaald. In zeldzame gevallen, waar er een probleem is bij het bepalen van de absolute configuratie, wordt de Éénkristal X-ray analyse gebruikt. De conventionele scheidingstechnieken zijn tijdrovend en vermoeiend. De directe afbreekbaarheid van een bekwame scheidingstechniek met efficiënte spectroscopische technieken zoals HPLC-FTIR kan worden gebruikt om het verwijderingsproces te ondersteunen . HPLC-FTIR is gebruikt om functionele groepen in hoofdbestanddelen van mengsels op te sporen, maar is vanwege beperkingen in Compatibiliteit niet uitgebreid toegepast; d.w.z. het verkrijgen van een optimale scheiding met adequate detectie .

een van de nieuwe technologieën voor de ontdekking van geneesmiddelen uit natuurlijke producten is het gebruik van capillaire elektroforese (CE) in het screeningsprogramma dat Voor het eerst werd ontwikkeld door Cetek Corporation en Cubist. De analyse kan actieve natuurlijke productsamenstellingen/ extracten identificeren en door om het even welke verschuiving in de proteã ne te ontdekken wanneer ligand aan het toe te schrijven aan de conformational en de veranderingen van de oppervlaktelast bindt. De ce-techniek kan onderscheid maken tussen zwakke en sterke bindmiddelen in extracten alvorens hun concentratie te bepalen . Deze technologie is toegepast op Cetek ‘ s interne drug discovery program in het vinden van nieuwe natuurlijke product verbindingen die het kankerdoel remmen, HSP90, een moleculaire chaperonine die verantwoordelijk is voor het handhaven van de juiste vouwen en stabiliteit van eiwitten . Een ander interessant voorbeeld dat onlangs werd gemeld door Wang, et al.toonde aan dat een CE-methode in combinatie met vloeibare chromatografie-tandem massaspectrometrie (LC-MS/MS) met succes is toegepast in het screenen van plantenextracten, met succes geïdentificeerd een natuurlijke verbinding genaamd baicalin van Radix scutellariaeas een nieuwe eiwit kinase een inhibitor . In een andere aparte studie, Zhao en Chen, ontwikkelden een eenvoudige en effectieve neuraminidase-geïmmobiliseerde capillaire microreactor gefacbriceerd door glutaaraldehyde cross-linking technologie voor screening van de neuraminidaseremmers van traditionele Chinese geneesmiddelen. Zes van de achttien natuurlijke producten met inbegrip van bavachinin, bavachin, baicalein, baicalin, chrysin, en vitexin zijn gevonden Als krachtige inhibitors van de screening. Enkele belangrijke aspecten van CE die een erkenning verdienen in dit hoofdstuk zijn het gebruiksgemak, de veelzijdigheid en de scheidingscomponenten met hoge resolutie, de hoge scheidingsefficiëntie en het lage monster-en reagensverbruik.

Flow injection analysis-NMR (FIA-NMR) omvat een monster dat als een plug in een vloeistofstroom wordt geïnjecteerd en vervolgens in de NMR-detectorspoel wordt geveegd. In een FIA-NMR wordt de mobiele fase gebruikt als een hydraulisch duwoplosmiddel dat het geïnjecteerde monster van de injectorpoort naar de NMR-stroomcel overbrengt. De scout scan die wordt gebruikt om de locatie van de oplosmiddelpieken te bepalen wordt verkregen door de spectrometer zodra de pomp stopt. Tenslotte wordt een signaal naar de oplosmiddelpomp gestuurd zodat het oude monster van de NMR-stroomcel kan worden uitgespoeld . HPLC-NMR-lidstaten is een nieuwe en meest geavanceerde spectrometrische methode die in de de-replicatie van natuurlijke productuittreksels wordt gebruikt . Ondanks het zijn de meest efficiënte methode, is het voordeel van bovengenoemde afgebroken methodologie de aanpassing van de gegevens van lidstaten aan het NMR-spectrum. Daarnaast is de informatie van de functionele groepen (bijv., hydroxyl en aminozuren) die worden geleverd door HPLC-NMR wordt gemakkelijk geà dentificeerd door MS-technieken. De komst van hogere veldmagneten en cryo-sondes had HPLC-NMR bewezen om een sterk en efficiënt spectroscopisch instrument te zijn en toegepast op de ruwe extracten (NMR en UV-profiel van PDA HPLC-opsporing). Er is een significante verbetering in het profileren gevoeligheid en de-replicatie van natuurlijke producten toe te schrijven aan het gebruik van hogere veldmagneten en de recente ontwikkelingen van de micro-rol HPLC-NMR en capillaire NMR (CapNMR) die voor kleinere hoeveelheden steekproeven heeft toegestaan om in de Orde van 40-120 µL worden onderzocht . De micro-spoel HPLC-NMR is het meest geschikt voor online HPLC-NMR die de on-stroom, stop-stroom of tijd het tot zwijgen brengen experimenten gebruikt om componenten huidig in grotere concentraties te scheiden en analyseert hetzelfde , terwijl de capillaire NMR de niet-deuterated oplosmiddelen in een off-line HPLC scheiding gebruikt waardoor een brede waaier van oplosmiddelen met lage kosten wordt aangeboden. De geïsoleerde samenstellingen worden opnieuw opgelost in deuterated oplosmiddelen en dan ingespoten in de CapNMR-stroomsonde gebruikend volumes van rond 6 µL met 1h-NMR spectra verworven voor steekproefhoeveelheden in de Orde van 2-30 µg, waardoor de gevoeligheid met een vooruitzicht om de nieuwe secundaire metabolites op laag niveau te classificeren wordt verhoogd .

naast het bovenstaande is de informatie verkregen uit de 1D-en 2D-NMR-spectra voldoende om de verbindingen te classificeren, naast het verstrekken van een “high-fidelity” – momentopname van de bestanddelen in het extract, waardoor de informatie wordt verkregen die de weg vrijmaakt voor rationele beslissingen over de bovenste fractioneringsmethode of om verder te gaan met de isolatie. Veel recente publicaties zijn met behulp van deze aanpak gerapporteerd .De techniek en het gebruik van HPLC-NMR in natuurlijke productenidentificatie/classificatie worden goed erkend in de literatuur maar de toepassingen van zijn gebruik hebben hoofdzakelijk slechts het chemische profileren van installaties behandeld . Talrijke wijzen van HPLC-NMR (meestal op-stroom en stop-stroom wijzen) combineren de oplossende macht van chromatografie, die met het structurele begrip door NMR wordt verbonden. De reductionistische aanpak is niet erg succesvol geweest in het ontdekken van effectieve geneesmiddelen voor de behandeling van complexe ziekten, zoals kanker, metabole, cardiovasculaire en neurologische ziekten. De enig-doeldrugs kunnen niet altijd het gewenste effect aan het gehele biologische systeem veroorzaken zelfs als zij met succes een specifiek doel remmen of activeren.Er zijn beperkingen in het gebruik van reductionistische of mono-doelbenadering in drugontdekking. De aanpak levert slechts een beperkt begrip op van gecompliceerde pathogenese en multi-target pathologieën van systemische ziekten zoals kanker, hart-en vaatziekten en neurodegeneratieve aandoeningen. Het is moeilijk om relevante maatregelen te identificeren om dergelijke complexiteit aan te pakken. Op Bullet-gebaseerde of mono-target druginterventie kan de complexe pathologieën van systemische ziekten niet effectief bestrijden aangezien zij door complexe biologische netwerken worden gereguleerd en van veelvoudige stappen van genetische en milieuuitdagingen afhangen om vooruitgang te boeken. Onlangs is er een groeiende belangstelling om innovatieve benaderingen van drugontdekking van natuurlijke producten door netwerkfarmacologie te gebruiken die systeembiologie en farmacologie integreert . Het geïntegreerde multidisciplinaire concept van multiple targets, multiple effects en complexe ziekten in de netwerkfarmacologie hebben ons begrip van gecompliceerde pathogenese en multi-target pathologieën van systemische ziekten verrijkt en de moeilijkheid verminderd bij het identificeren van relevante interventies om dergelijke complexiteiten te richten. De’ – omic ‘ technologieën in de systeembiologie zijn nu op grote schaal gebruikt om meerdere targets en netwerken van menselijke ziekten en drugacties te correleren en te verduidelijken . Het concept van netwerkfarmacologie is vooral nuttig bij het nauwkeurig vertalen en interpreteren van de therapeutische effecten van kruidengeneesmiddelen in moderne biochemische en biologische betekenissen. Kruidengeneesmiddelen kunnen dienen als waardevolle middelen voor netwerk-gebaseerde multi-target drug discovery. Het concept van netwerkfarmacologie is vooral nuttig bij het nauwkeurig vertalen en interpreteren van de therapeutische effecten van kruidengeneesmiddelen in moderne biochemische en biologische betekenissen. De werkzaamheid van de multi-target drugs van kruidenextracten worden ontwikkeld gevolgd door identificatie van hun belangrijkste bioactieve componenten en herontwikkeling van een volledig nieuwe multi-component formuleringen samengesteld uit de belangrijkste bioactieve componenten om een synergetische en optimale combinatie te bereiken .

het combineren van natuurproduct chemie en metabolomics benaderingen in drug discovery is een nieuwe strategie om nieuwe geneesmiddelen te ontdekken. Er zijn weinig rapporten in de wetenschappelijke literatuur, die unison van klassieke benaderingen van de natuurlijke productchemie met metabolomics bespreken om nieuwe bioactieve natuurlijke producten te identificeren. Deze zijn over het algemeen gericht op de studie van planten . De identificatie van bioactieve natuurlijke producten uit planten blijft een veelzijdige taak vanwege hun hoge chemische diversiteit en complexiteit. Door metabolome van verschillende extracten of fracties van een installatie te meten en deze gegevens met zijn overeenkomstige biologische activiteit te combineren, kunnen de signalen met betrekking tot de samenstellingen met betrekking tot de getoond activiteit potentieel worden bepaald. Systeembiologie is een veelbelovend veld dat hulpmiddelen omvat in de post-genomicarevolutie zoals transcript omics, proteomics, glycomics en fluxomics met de intentie om alle gen-en celproducten volledig te karakteriseren inclusief mRNA, eiwitten, glycaanstructuren en metabolieten. Metabolomics streeft naar het construeren van evenwichtige waarnemingen gebruikend hoogst reproduceerbare hulpmiddelen die door de analyse van gegevens worden gevolgd om de correlaties tussen de beschikbare gegevens te lokaliseren. Het profileren van alle metabolites van het lage molecuulgewicht van een organisme is niet mogelijk en vandaar combineert dit opkomende gebied van metabolomics analytische chemie, biochemie en computationele biologie die de analyse van duizenden metabolites in om het even welk biologisch systeem toestaan. De belangrijkste analytische platforms zijn de massaspectrometrie met gaschromatografie (MS-GC), vloeistofchromatografie (LC) of capillaire elektroforese (CE) en NMR spectroscopie. Een uitgebalanceerde extractieprocedure om efficiënt alle primaire en secundaire metabolites uit weefsels en de lichaamsvloeistoffen te halen wordt gebruikt om hen in de natuurlijke vorm voorafgaand aan de analyse in de diverse gebruikte oplosmiddelen te verkrijgen. De metabolite extractieprocedures zijn ingewikkelder en complexer toe te schrijven aan de gediversifieerde aard van kleine molecules huidig en toe te schrijven aan de onbeschikbaarheid van één enkele analytische techniek en platform dat in analyse van alle metabolites tegelijkertijd helpt. Verscheidene scheidingstechnieken en methodologieën moeten worden toegepast om volledige analyse van metabolites te bereiken . Gelijktijdige analyse van honderden verbindingen wordt bereikt door verschillende hulpmiddelen in de informatica die informatie uit de gegevens haalt, het verwijderen van de achtergrondruis, detectie en integratie van pieken in grote datasets en het normaliseren en transformeren van de resulterende datamatrices voorafgaand aan een statistische analyse . Metabolomics heeft een beperkte toegang tot de capaciteit om de signalen met betrekking tot de chemische aard te identificeren. Ongeveer 60 tot 80 % van alle ontdekte samenstellingen zijn onbekend zelfs vandaag en de metabolische discipline heeft een grote massa van spectrale NMR bibliotheek tot stand gebracht om dit probleem aan te pakken. Deze Onbekende secundaire metabolite structuren kunnen één onder de onontdekte middelen van de natuurlijke producten zijn, zijn het vingerafdrukken nemen, voetdruk, het profileren of doelanalyses gemeenschappelijke die termen op dit gebied worden gebruikt. Fingerprinting heeft tot doel een ‘momentopname’ van het organisme te maken waarbij de signalen niet noodzakelijk kunnen worden gebruikt om specifieke metabolieten te detecteren/identificeren en sterk afhankelijk zijn van de gebruikte techniek. De signalen worden toegewezen aan metabolite ongeacht zijn aard om een bekende of een nieuwe samenstelling te zijn. De term doelanalyse heeft tot doel een specifieke metaboliet van belang te bepalen en te kwantificeren .

de microarray is een nieuwe technologie die onlangs is ontwikkeld en die de wetenschappelijke gemeenschap in staat heeft gesteld om de fundamentele aspecten te begrijpen die de groei en ontwikkeling van het leven onderstrepen en om de genetische oorzaken van anomalieën in het functioneren van het menselijk lichaam te onderzoeken.De technologie van DNA microarray kan veranderingen in DNA of proteã ne analyseren en vergelijken. Een chromosomale verandering in een abnormaal individu zou kunnen worden geà dentificeerd wanneer DNA van dit individu met DNA (controle) van een gezond individu wordt vergeleken. Het is zeer nauwkeurig en nuttig in die zin dat het veel kleinere veranderingen in vergelijking met conventionele karyotyping techniek kan ontdekken. Deze bekwame techniek stelde ons in staat om de elementaire aspecten te begrijpen die de groei en ontwikkeling van het leven onderstrepen, evenals om de genetische oorzaken van anomalieën te onderzoeken die zich in het functioneren van het menselijk lichaam voordoen. Microarray-technologie is uitgebreid gebruikt in pharmacogenomics waar de vergelijkende analyse van de genen van een ongezonde en een normale cel de identificatie van de biochemische constitutie van de proteã nen zal helpen samengesteld door de abnormale/ongezonde genen. De informatie die uit de analyse dan wordt verkregen zou voor synthese en ontwerp van drugs kunnen worden gebruikt die de abnormale proteã nen bestrijden en hun effect verminderen .Kwon en zijn collega ‘ s hebben een in vitroaanpak ontwikkeld gebruikend een multi-enzym dat microarray systeem voor high-throughput synthese van polypeptide afgeleid product en hun daaropvolgende volledige polyketide-gebaseerde bibliotheekonderzoek van het menselijke tyrosinekinase (TK), op één glas microarray bevat. Van de TK-remmers wordt verwacht dat ze chronische myeloïde leukemie, gastro-intestinale stromale tumoren en borstkanker behandelen .

een drug discovery program is gericht op het vinden van nieuwe bioactieve natuurlijke producten, die een of andere vorm van krachtige biologische activiteit bezitten. Het isoleren van bekende en ongewenste natuurlijke producten zonder farmacologisch belang of chemische is echter onvermijdelijk. De term dereplicatie die een proces is van het identificeren van bekende verbindingen die verantwoordelijk zijn voor de activiteit van een extract voorafgaand aan bioassay-geleide isolatie wordt populair onder de onderzoekers van natuurlijke producten . De strategieën van dereplicatie omvatten over het algemeen een combinatie van bioassay, scheidingswetenschap, spectroscopische methoden, en het zoeken van gegevensbestanden en kunnen als chemische of biologische screeningsprocessen worden beschouwd. Er zijn een aantal manieren waarop natuurproductprogramma ’s dereplicatie benaderen, die is gebaseerd op beschikbaarheid van screeningsmethoden/instrumentatie, tijd en de kosten om mogelijke’ biologische leads of nieuwe verbindingen ‘ uit een ruw extract te identificeren. Momenteel zijn er vele geavanceerde methodologieën en protocollen die nieuwe entiteiten van bekende natuurlijke samenstellingen in een vroeg stadium van een programma van de drugontdekking of in een strategie van de natuurlijke productisolatie onderscheiden . Het verwijderingsproces kan gemakkelijk worden gedaan door de samenstellingen door de commercieel beschikbare gegevensbanken te screenen, die de tijd voor structuur opheldering van bekende samenstellingen verminderen. Een voorbeeld is het Chapman and Hall Dictionary of Natural Products ; het Dictionary of Marine Natural Products (on-line) (subset van het Dictionary of Natural Products) dat meer dan 30.000 verbindingen bevat; MarinLit – de mariene Natuurlijke Producten Database met actuele bibliografische gegevens over mariene organismen met het aantal referenties uit 1 200 tijdschriften / boeken en gegevens voor ~ 21.000 verbindingen ; Antimarine is een recentere database, waarin het aantal methylgroepen, het aantal SP3-gehybridiseerde methyleen-of methineprotonen, alkeen -, acetaal -, ether-en formylgroepen kan worden doorzocht . Daarnaast zijn Scfinder Scholar en SCOPUS belangrijke onderzoeksontdekkingsinstrumenten (Chemical Abstracts online) en is NAPRALERTTM een database van alle natuurlijke producten, inclusief etnomedische informatie, farmacologische/biochemische informatie van extracten van organismen in vitro, In situ, in vivo, bij mensen (case reports, niet-klinische studies) en klinische studies . De beschikbaarheid van deze wetenschappelijke databases, zoals die welke aan de onderzoeks-en academische instellingen worden genoemd, is een fundamentele en cruciale stap in een goed beheerd natuurproductprogramma. Met de stijging van het aantal nieuwe drugdoelstellingen, zijn computationele methodes zoals hoge productie virtuele screening, ligand docking hulpmiddelen, ADME (absorptie, distributie, metabolisme en uitscheiding) profilering en andere moderne computationele hulpmiddelen en software toegepast om het proces van de drugontdekking te versnellen. Enkele gemeenschappelijke natuurlijke productenbibliotheken en databases zoals hieronder vermeld staan de snelle screening van groot aantal natuurlijke samenstellingen toe die in korte tijd tegen een verscheidenheid van drugdoelstellingen moet worden gedaan. Dictionary Of Natural Products (http://dnp.chemnetbase.com/intro/index.jsp); UCSD Marine Natural Products Database (http://naturalprod.ucsd.edu/); Natural Products Alert (http://napralert.org/) ;zink (http://zinc.docking.org/browse/catalogs/natural-products) ; InterBioScreen (http://www.ibscreen.com/products.shtml); AnalytiCon Discovery (http://www.ac-discovery.com/);Molecular Diversity Preservation International (http://www.mdpi.org/). Computergegenereerde modellen van eiwitten, met inbegrip van nieuwe enzym – en receptordoelen, afgezien van de eiwitkristalstructuren die worden gedeponeerd in de Eiwitdatabank (http://www.pdb.org/), kunnen gemakkelijk worden gegenereerd door homologiemodellering, gevolgd door eenvoudige moleculaire docking om de interacties tussen de natuurlijke verbindingen en de eiwitdoelen te onderzoeken. Bioassays kunnen dan selectief op de natuurlijke slagen of leiden worden geleid die zonder de necesities van het verspillen van de kostbare hoeveelheid de samenstellingen worden opgehaald en dure en tijdrovende experimentele methodes vermijden. Voorbeelden van moleculaire docking Software die momenteel beschikbaar zijn zijn AutoDock, AutoDockVina, FlexX, FRED, GOLD, eHiTS, en Lead finders. Enkele voorbeelden met behulp van hoge doorvoer virtuele screening met inbegrip van het werk van Wang et al. waar tien natuurlijke verbindingen met succes zijn geïdentificeerd als flacipain – 2 (FP-2) remmers en Liu et al. die een natuurlijke product-achtige STAT3 dimerisatie inhibitor hebben geïdentificeerd door structuurgebaseerde virtuele screening .

Andere hulpmiddelen voor bio-informatica, zoals ligand-en structuurgebaseerde farmacologische screening, zijn ook succesvol gebleken bij het helpen van het proces van het ontdekken van geneesmiddelen uit natuurlijke producten. Chen et al. hebben voorgesteld een driedimensionaal kwantitatief structuur-activiteit relatie farmacophore model gebaseerd op bekende mTOR remmers. Virtuele screening met behulp van de beste pharmacophore model met succes opgehaald 20 natuurlijke producten als potentiële mTOR inhibitors steigers. Het is ook belangrijk om hier te vermelden dat uit de vorige studie door Doman bleek dat van 365 moleculen voorgesteld door docking, 127 (34,8%) van hen remde de activiteit van enzym eiwit tyrosine fosfatase-1B (PTP1B) terwijl slechts 85 (0,021%) van ongeveer 400, 000 moleculen werden opgehaald uit high-throughput experimentele analyse. Dat is ongeveer 1700-voudige verrijking van hit rate van structuur-gebaseerde docking over willekeurige screening .Anderzijds, staat de integratie van chemoinformatic hulpmiddelen in drugontdekking van natuurlijke producten toe om de samenstellingen op hun ADMET (absorptie, distributie, metabolisme, uitscheiding, en giftigheid) eigenschappen worden gescreend alvorens zij in om het even welke programma ‘ s van de drugontwikkeling worden ingeschreven. Screening van natuurlijke verbindingen met behulp van de Pfizer ‘regel van 5’ stelt de onderzoekers in staat om moleculen te verwijderen die zich niet aan de regels houden. Aangezien deze regels werden afgeleid van een set van experimentele waarnemingen van duizenden bekende geneesmiddelen en drug-achtige moleculen, kan een opgeleide medicinale chemicus/biochemicus gemakkelijk gebruik maken van de in silicodata als een gids bij het bepalen van de potentiële drug-achtige natuurlijke verbindingen gevolgd door de synthese van verdere analogen, zodat ze een gunstige drug-achtige eigenschappen zou hebben. Een goed geneesmiddelachtig molecuul voldoet in het algemeen aan de volgende regels: I) molecuulgewicht ≤ 500, ii) berekende logP ≤ 5, iii) aantal waterstofbindingsdonoren ≤ 5, en iv) aantal waterstofbindingsacceptoren ≤ 10. De introductie van silicoscreening en natuurlijke producten Faciliteiten voor high-throughput screening in academische laboratoria en in farmaceutische bedrijven verminderen de kosten van willekeurige screening van zeer grote collecties van verbindingen. In silicoor helpt virtuele screening om het aantal verbindingen dat in echte schermen wordt gebruikt te filteren . Aan de andere kant, bioinformatische tool zoals het woordenboek van natuurlijke producten geeft structurele informatie over 150.000 verschillende verbindingen die kunnen worden gebruikt in virtuele screening, hoewel de verbindingen nog fysiek beschikbaar zou moeten zijn voor elke voorspelde activiteit te bevestigen door middel van testen in een relevante analyse. Ten slotte kan clustering van chemisch verwante steigers zeer nuttig zijn bij het begeleiden van de synthese van nieuwe verbindingen, maar uiteraard is er een vertraging en kosten in de synthese.

een academische samenwerking heeft het Drug Discovery Portal opgericht (zie http:// www.ddp.strath.ac.uk/) in een poging om de technieken van virtuele screening van chemisch diverse natuurlijke producten en hun synthetische analogen te combineren met de snelle beschikbaarheid van fysieke monsters voor het testen, maakt dit een breed scala van verbindingen uit academische laboratoria in veel verschillende instellingen in een database die kan worden gebruikt voor virtuele screening. Academische biologie groepen stellen ook nieuwe en nieuwe eiwitstructuren voor als doel voor virtuele screening met de database van het portaal (en met conventionele commercieel beschikbare databases). Wanneer treffers worden voorspeld van de in silicoscreening, kunnen de verbindingen worden verkregen van de oorspronkelijke chemicus voor bevestigende tests. Vaak is er een directe link naar expertise voor de voorbereiding van analogen om te helpen bij het starten van een lead optimalisatie programma. Niettemin is de toegang tot het portaal vrij toegankelijk voor de academische groep. De voortdurende uitbreiding van de chemische database betekent dat er een waardevolle en groeiende dekking van de chemische ruimte van vele nieuwe chemische verbindingen. Hoewel de verbindingen in de database van het portaal over het algemeen al in een proefschrift of in een chemietijdschrift zullen zijn onthuld, zijn er maar weinig van hen eerder getest op biologische activiteit. Dit is een gemeenschappelijk kenmerk van bekende natuurlijke producten: van de 150.000 structuren in het CRC woordenboek van natuurlijke producten is slechts 1% onderzocht. De introductie van metabolomicstechnologieën in de processen van de natuurlijke productontdekking zal op veelvoudige niveaus voordelig zijn. Door het aantal identificaties in onze metabolomicsgegevens te verhogen, kunnen de samenstellingen met nieuwe structuren gemakkelijk voor om het even welke ziekte in onderzoek worden verkregen en getest. Voorts zal de multi-parallelle analyse die metabolomicstechnologieën gebruiken ook de productie van chemische karakteriseringsprocessen van vele verschillende species van natuurlijke hulpbronnen verbeteren. Aangezien de natuurlijke product chemici een leven van samenstellingsbibliotheken van actieve en ook inactieve zuivere samenstellingen hebben verzameld, kunnen deze gegevens worden gebruikt om de spectrale massa en NMR spectrale bibliotheken te construeren, ongetwijfeld helpen de biologische interpretaties van metabolomicsgegevens met minder moeilijkheid worden gedaan. De vooruitgang in analytische instrumentatie en verfijnde afbreekbaarheid van scheidingstechnieken met hoge gevoelige detectoren hebben voor grotere opsporing van kleine molecuulsamenstellingen die in biologische systemen (d.w.z., primaire en secundaire metabolites) meetbaar zijn toegestaan. Deze technologieën kunnen worden gebruikt om de ontdekking van natuurlijke productchemie te bevorderen om potentiële nieuwe drugskandidaten te identificeren die in het ondersteunen van gezondheid en de strijd tegen ziekte en ziekte zullen helpen. In het geval van NMR van ruwe extracten, kunnen de patronen gemakkelijk worden gevisualiseerd en worden geïnterpreteerd gebruikend de multivariate gegevensanalyse. Dit kan worden uitgevoerd op een vergelijkende manier waarbij verschillen tussen relatief vergelijkbare extracten worden onderscheiden of het kan worden gekoppeld aan een specifieke (over het algemeen in vitro) biologische activiteit. Uiteindelijk laat dit de bouw van een complex gegevensbestand van metabolome toe .

Geef een antwoord

Het e-mailadres wordt niet gepubliceerd.